Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms