Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms