Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cfap58B2RW38 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cfap58B2RW38 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cfap58B2RW38 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms