Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rd3lB2RV38 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms