Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms