Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zscan5bB2RTN3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms