Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfc3h1B2RT41 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms