Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms