Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms