Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms