Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms