Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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