Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms