Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prr29B1ARI9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms