Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem235B1AQL3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms