Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatsperbA2RTF1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms