Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf39A2RT81 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms