Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms