Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samt1A2BED8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms