Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl41A2AUC9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms