Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GabreA2AMW3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms