Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam43bA2AM80 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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