Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SetxA2AKX3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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