Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Frmpd1A2AKB4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms