Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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