Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pramel3A2AHA7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramel3A2AHA7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms