Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

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Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms