Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700023F06RikA2AB62 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms