Protein–RNA interactions for Protein: A2AAE1

Kiaa1109, Uncharacterized protein KIAA1109, mousemouse

Predictions only

Length 5,005 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1109A2AAE1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Kiaa1109A2AAE1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Kiaa1109A2AAE1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Kiaa1109A2AAE1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Kiaa1109A2AAE1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Kiaa1109A2AAE1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Kiaa1109A2AAE1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Kiaa1109A2AAE1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Kiaa1109A2AAE1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Kiaa1109A2AAE1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Kiaa1109A2AAE1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Kiaa1109A2AAE1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Kiaa1109A2AAE1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Kiaa1109A2AAE1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms