Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms