Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm27029A2A4P4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms