Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul4bA2A432 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms