Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
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