Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2LB96

Trbv29, T cell receptor beta, variable 29 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv29A0A0G2LB96 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Trbv29A0A0G2LB96 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv29A0A0G2LB96 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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