Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms