Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1J5

Ighv9-3, Immunoglobulin heavy variable V9-3 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ighv9-3A0A0B4J1J5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ighv9-3A0A0B4J1J5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ighv9-3A0A0B4J1J5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ighv9-3A0A0B4J1J5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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