Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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