Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXN4

Ighv1-18, Immunoglobulin heavy variable V1-18 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-18A0A0A6YXN4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms