Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms