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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | TAF9BP1-201 | ENST00000396646 | 746 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | SNRPEP2-201 | ENST00000397592 | 279 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MS4A4E-201 | ENST00000398984 | 479 nt | TSL 5 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | Z93403.1-201 | ENST00000411879 | 895 nt | TSL 5 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC017079.2-201 | ENST00000416102 | 485 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC097717.1-228 | ENST00000417006 | 754 nt | TSL 3 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC009951.2-201 | ENST00000634873 | 644 nt | TSL 5 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC099654.7-201 | ENST00000635788 | 2127 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | ISPD-AS1-202 | ENST00000438573 | 2252 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RTN4-208 | ENST00000404909 | 4102 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MTRNR2L10-201 | ENST00000545075 | 1530 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | KLRC1-202 | ENST00000359151 | 1407 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | CACNB4-222 | ENST00000636350 | 7654 nt | TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | TAS2R10-201 | ENST00000240619 | 1042 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | FRG1BP-201 | ENST00000278882 | 761 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | OR8B3-201 | ENST00000354597 | 942 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | UTS2-202 | ENST00000361696 | 559 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RNA5SP42-201 | ENST00000364278 | 115 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | OR8B2-201 | ENST00000375013 | 942 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | UBA52P6-201 | ENST00000399822 | 382 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | U3.39-201 | ENST00000408569 | 239 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | LINC01052-201 | ENST00000437777 | 496 nt | TSL 3 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC092427.1-201 | ENST00000439177 | 601 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC010655.1-201 | ENST00000449336 | 292 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC025518.1-201 | ENST00000479856 | 347 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC020703.1-201 | ENST00000505051 | 521 nt | TSL 3 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC022483.1-201 | ENST00000514020 | 567 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC006077.1-201 | ENST00000604746 | 343 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC112220.2-201 | ENST00000605513 | 533 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | DUXAP10-204 | ENST00000612052 | 616 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC099654.8-201 | ENST00000637757 | 681 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MLF1-203 | ENST00000392822 | 2157 nt | TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MGAT4C-202 | ENST00000548651 | 2159 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | ELF1-201 | ENST00000239882 | 3566 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AGL-206 | ENST00000370165 | 7106 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | OXR1-205 | ENST00000442977 | 2956 nt | TSL 2 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | CHD9-213 | ENST00000564845 | 11504 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MACF1-204 | ENST00000372915 | 23440 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RNU6-216P-201 | ENST00000363282 | 104 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RNU6-224P-201 | ENST00000384055 | 107 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | U3.19-201 | ENST00000390893 | 196 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MTATP6P27-201 | ENST00000416987 | 621 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MTND4P3-201 | ENST00000417829 | 541 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RPS15AP6-201 | ENST00000420703 | 385 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | ERMN-209 | ENST00000420719 | 1246 nt | TSL 2 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RPF2P1-201 | ENST00000424137 | 906 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC017074.1-201 | ENST00000424612 | 561 nt | TSL 3 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | ANKRD10-IT1-201 | ENST00000426991 | 800 nt | TSL 2 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL033504.1-201 | ENST00000427015 | 773 nt | TSL 2 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL590233.1-201 | ENST00000430017 | 456 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | LINC01797-202 | ENST00000433432 | 765 nt | TSL 3 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC092798.1-201 | ENST00000458542 | 409 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC023598.1-201 | ENST00000472521 | 361 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RPS26P21-201 | ENST00000475397 | 348 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RPL31P60-201 | ENST00000478450 | 367 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |