Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ITSN1Q15811 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ITSN1Q15811 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ITSN1Q15811 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ITSN1Q15811 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ITSN1Q15811 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ITSN1Q15811 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ITSN1Q15811 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ITSN1Q15811 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ITSN1Q15811 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ITSN1Q15811 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ITSN1Q15811 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ITSN1Q15811 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ITSN1Q15811 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ITSN1Q15811 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ITSN1Q15811 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ITSN1Q15811 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ITSN1Q15811 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ITSN1Q15811 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ITSN1Q15811 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ITSN1Q15811 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ITSN1Q15811 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ITSN1Q15811 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ITSN1Q15811 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ITSN1Q15811 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.59□□□□□ -2
ITSN1Q15811 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.59□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC2.59□□□□□ -2
ITSN1Q15811 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -2
ITSN1Q15811 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
ITSN1Q15811 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.59□□□□□ -2
ITSN1Q15811 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC2.59□□□□□ -2
ITSN1Q15811 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ITSN1Q15811 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ITSN1Q15811 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ITSN1Q15811 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ITSN1Q15811 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ITSN1Q15811 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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ITSN1Q15811 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ITSN1Q15811 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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ITSN1Q15811 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITSN1Q15811 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITSN1Q15811 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ITSN1Q15811 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITSN1Q15811 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITSN1Q15811 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ITSN1Q15811 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITSN1Q15811 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ITSN1Q15811 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITSN1Q15811 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ITSN1Q15811 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITSN1Q15811 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ITSN1Q15811 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ITSN1Q15811 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
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