Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IRF4Q15306 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms