Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SPTAN1Q13813 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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