Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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