Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms