Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms