Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
NEUROD1Q13562 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms