Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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RTN1Q16799 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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RTN1Q16799 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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RTN1Q16799 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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RTN1Q16799 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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RTN1Q16799 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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RTN1Q16799 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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RTN1Q16799 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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RTN1Q16799 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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RTN1Q16799 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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