Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
USF2Q15853 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USF2Q15853 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USF2Q15853 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USF2Q15853 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USF2Q15853 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
USF2Q15853 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
USF2Q15853 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
USF2Q15853 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
USF2Q15853 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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