Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms